Холмский музей фауны моря – один из старейших музеев Сахалинской области. До 1975 года располагался в посёлке Антоново в Сахалинском отделении Тихоокеанского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии (СахТИНРО). Институт был создан в 1945 году на базе японского научного учреждения. После переезда СахТИНРО в Южно-Сахалинск музей остался в Антоново, но к 1978 году, потеряв поддержку, прекратил работу и часть его уникальных коллекций была утрачена.
В ноябре 1980 года было решено воссоздать музей на основе сохранившихся экспонатов в городе Холмске. С момента восстановления он несколько раз переезжал, но коллекция экспонатов пополнялась.
Сегодня основу фондов составляют естественнонаучные коллекции: рыбы, беспозвоночные, птицы, млекопитающие, а также краеведческие материалы – предметы быта и охоты айнов, японские артефакты периода Карафуто, фотографии, печатные издания и другие предметы.
Музей включает три зала:
Фонды музея насчитывают более 10 тысяч экспонатов: археологические находки, документы, фотографии, живопись, этнографические предметы, коллекции по геологии, палеонтологии, нумизматике, истории техники, редкие книги и богатейшие естественнонаучные собрания.
Посетить экспозицию можно самостоятельно или с экскурсоводом.