Ботанический сад появился в Южно-Сахалинске в 1991 году, а в 2003 году стал филиалом Дальневосточного отделения Российской академии наук. Его площадь – около 40 гектаров. Территория разделена на пять зон: заповедную, экспозиционную, зону питомников, коллекционные участки и резервную.
Здесь представлены декоративные кустарники, многолетние травянистые растения, деревья, тропические и субтропические растения – большинство из них выращены на Сахалине впервые. Встречаются также редкие и эндемичные виды, сохранением которых занимаются сотрудники сада. Также они ведут исследовательскую работу и поддерживают связи с ботаническими учреждениями из 54 стран мира.
Специально для посетителей в ботаническом саду оборудовали прогулочные дорожки и эко-тропы. Жители и гости Южно-Сахалинска могут познакомиться с флорой и фауной острова и даже приобрести некоторые из растений для самостоятельного разведения.